Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC80O14777 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC80O14777 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDC80O14777 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDC80O14777 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC80O14777 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC80O14777 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC80O14777 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC80O14777 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC80O14777 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC80O14777 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC80O14777 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC80O14777 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC80O14777 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC80O14777 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC80O14777 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC80O14777 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC80O14777 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC80O14777 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC80O14777 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC80O14777 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC80O14777 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC80O14777 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms