Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPH6UMI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GABARAPH6UMI1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPH6UMI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms