Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KPZ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms