Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP11Q9Y3A2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms