Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THSD7AQ9UPZ6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THSD7AQ9UPZ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms