Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGSF9BQ9UPX0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms