Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms