Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms