Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRPC4Q9UBN4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms