Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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