Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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