Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXC10Q9NYD6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC10Q9NYD6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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