Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms