Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF1Q9H7N4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms