Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXF3Q9H4D5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms