Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms