Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN6Q9BZV1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms