Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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