Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms