Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHOX2BQ99453 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms