Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP47Q96K76 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms