Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms