Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms