Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-12■■■■■ 41.4
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-12■■■■■ 41.4
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 41.4
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 27.54□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 41.4
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 PDPR-203ENST00000561920 2194 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-13■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-13■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-203ENST00000379773 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-208ENST00000508738 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-13■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 C7-203ENST00000486779 564 ntTSL 23.78□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 COBLL1-222ENST00000493921 507 ntTSL 37.4□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 COBLL1-216ENST00000480873 714 ntTSL 32.2□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 COBLL1-211ENST00000452626 772 ntTSL 51.92□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 41.1
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL4-212ENST00000528858 763 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 41
DGCR8Q8WYQ5 AC016831.1-202ENST00000447307 726 ntTSL 35.83□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 40.9
DGCR8Q8WYQ5 NCOR2-209ENST00000440187 467 ntTSL 512.23□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 MICAL3-212ENST00000498573 593 ntTSL 313.98□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 MICAL3-215ENST00000578984 569 ntTSL 313.75□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 SLC8B1-205ENST00000548518 664 ntTSL 411.66□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 40.8
DGCR8Q8WYQ5 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.119e-7■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TPM2-205ENST00000471212 1363 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.45□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-209ENST00000473043 1075 ntTSL 56.65□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-208ENST00000473003 593 ntTSL 45.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 40.7
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-211ENST00000476181 660 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-205ENST00000464564 469 ntTSL 511.81□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 310.42□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 40.6
DGCR8Q8WYQ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 PER1-203ENST00000577253 589 ntTSL 416.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 PER1-212ENST00000581395 3209 ntTSL 216.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 PER1-217ENST00000584202 576 ntTSL 59.95□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 40.5
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-210ENST00000557984 478 ntTSL 224.99■■□□□ 1.594e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.14e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.774e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.524e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.464e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.354e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.294e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 516.01■□□□□ 0.154e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 04e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 514.74□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 514.59□□□□□ -0.074e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.144e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 TLE3-224ENST00000560996 495 ntTSL 512.06□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 MIR629-201ENST00000385230 97 ntBASIC8.5□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 40.4
DGCR8Q8WYQ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 40.3
DGCR8Q8WYQ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 40.3
DGCR8Q8WYQ5 NR2F1-AS1-204ENST00000510254 862 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 40.3
DGCR8Q8WYQ5 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 40.3
DGCR8Q8WYQ5 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 40.3
DGCR8Q8WYQ5 NUPL2-207ENST00000485250 2010 ntTSL 518.16■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 40.2
DGCR8Q8WYQ5 NUPL2-205ENST00000438012 1653 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 40.2
DGCR8Q8WYQ5 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 40.2
DGCR8Q8WYQ5 NUPL2-203ENST00000413919 1329 ntTSL 313.04□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 40.2
DGCR8Q8WYQ5 NUPL2-209ENST00000487595 623 ntTSL 311.28□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 40.2
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 96.5 ms