Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms