Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIEQ8NEW7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms