Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL3Q8N8U3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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