Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf33Q6P1S2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms