Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms