Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSMD4Q5XG99 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms