Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms