Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM69BQ5VUD6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms