Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms