Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM187BQ17R55 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms