Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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