Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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