Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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