Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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RPE65Q16518 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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