Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms