Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms