Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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