Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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