Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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