Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms