Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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