Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms