Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATRQ13535 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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