Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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