Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CALCOCO2Q13137 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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