Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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NR1H3Q13133 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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NR1H3Q13133 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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NR1H3Q13133 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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